구글 알파폴드3 깃허브 공개 - 분자들의 상호 작용을 예측하는 모델

구글 딥마인드가 AlphaFold 3를 GitHub에 공개했다.

GitHub - google-deepmind/alphafold3: AlphaFold 3 inference pipeline.

AlphaFold 3의 코드와 모델 파라미터를 포함하고 있으며, 비상업적 연구 목적으로 사용할 수 있다.

알파폴드3란?

AlphaFold 3는 Google DeepMind와 Isomorphic Labs가 공동 개발한 AI 모델이다.

단백질뿐만 아니라 DNA, RNA, 리간드 등 생체 내 모든 분자의 구조와 상호작용을 예측하는 모델이다.

AI 이미지 생성에 사용되는 것과 유사한 diffusion 네트워크를 통해 예측을 수행한다.

원자 단위의 입력 데이터를 처리 할 수 있고 상관관계를 고려할 수 있다.

그렇기 때문에 모든 생물학적 분자의 구조와 상호작용을 예측할 수 있다.

새로 공개된 알파폴드3의 제약

• AlphaFold 3의 사용은 하루에 20개의 예측으로 제한되며, 약물과 관련된 단백질 구조는 계산할 수 없다.

• 제한 이유는 Isomorphic Labs가 AlphaFold 3를 약물 발견에 사용하기 때문이다.

• AlphaFold 2는 오픈 소스이지만 AlphaFold 3는 그렇지 않다.

알파 폴드의 긍정적 활용방안

• 단백질 - 약의 상호작용을 예측할 수 있기 때문에 실험적 데이터에 의존하지 않아도 된다.

• 단백질-리간드 결합 구조 예측으로 신약 후보 물질 발굴 가속화. (리간드(ligand)는 생화학에서 특정 단백질에 결합할 수 있는 분자를 의미합니다.)

• 항체-항원 결합 예측으로 면역 치료제 개발 지원

이런 일들을 바탕으로 원자 수준의 상호작용을 이해할 수 있고 생명과학 연구와 신약 개발 과정에 긍정적인 영향을 끼칠 수 있습니다.